ארגון "שערי עזרא" הוקם בשנת תשע"א כבית חינוך והצלה לנוער מתמודד. על שמם של הרבנים הגאונים הגאון רבי עזרא הררי רפול זצ"ל והגאון רבי עזרא עטייה זצ"ל.
פעילות הארגון החלה בעיר נתיבות בפעילות לנוער, הקמת ישיבת לימוד בלילי שישי מידי שבוע, ועזרה מקצועית בנוער מתמודד.
עם השנים התרחבה פעילות הארגון ליתר ערי הדרום. וכיום הפעילות מקיפה את הערים באר שבע, אופקים, נתיבות, שדרות, אשקלון, ואשדוד!
בשנת תשע"ו הקים הארגון 'מדרשיה לנוער מתמודד' בעיר נתיבות, תחת הנחייתו המלאה של הרב הגאון רבי חיים מגורי שליט"א מרבני הקהילה.
מייסד הארגון הרב יוסף הררי רפול שליט"א מחנך ור"מ בישיבות, שם לו למטרה לא להשאיר אף מתמודד מאחור. וביחס אישי ומקצועי דואג עבור כל נער כמו היה בנו היחיד.
ארגון 'שערי עזרא' חרט על דגלו להוות בית חינוך והצלה לנוער, לתת את כל המענה החינוכי הנדרש בשנות הבחרות של נערי ישראל.
הארגון מקיים אף ימי עיון וכנסי מחנכים לליבון ופיתוח דרכי חינוך, לנוכח האתגרים החינוכיים העולים על שולחנם של גדולי ישראל שליט"א עקב ההתפתחויות הטכנולוגיות, וקשיי השעה.
הארגון זכה לברכתם והסכמתם של גדולי ישראל שליט"א, ובפרט על ידי רבני הקהילה בנתיבות שליט"א.